热门的文章 - 第24页

RankComp包算法解析

数据准备： 1、表达矩阵，比如300个样本，20000个基因 2、表达矩阵分成癌症样本矩阵假设200个样本（C）和正常样本矩阵假设100个样本(E) 3、取正常样本矩阵E 4、取表达谱矩阵E中的任意基因g...

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祝让飞
发布于 2018-05-01 19:27
阅读 ( 4701 )

文献解读（2）通过膀胱癌肿瘤突变负荷和免疫治疗的关系来进行多组学分析

结合TCGA数据库中膀胱癌的体细胞突变数据计算病人的TMB值，基于该值的中位数值将样本划分为高TMB组合低TMB组，首先刻画高低TMB组生存的差异；接下来，结合膀胱癌病人的表达谱数据，识别高低TMB组差异的基因，使用单因素和多因素cox回归分析进而结合构建了由8个基因组成的膀胱癌预后模型；考虑到TMB值和免疫治疗的关系，使用CIBERSORT软件对膀胱癌病人中22中免疫细胞的组成刻画，基于单因素cox回归分析，找到潜在影响病人生存的免疫细胞类。

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柚子
发布于 2019-11-18 18:22
阅读 ( 4686 )

用lasso做预后模型的简易工具

Lasso是Least Absolute Shrinkage and Selection Operator的简称，是一种采用了L1正则化（L1-regularization)的线性回归方法，采用了L1正则会使得部分学习到的特征权值为0，从而达到稀疏化和特...

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admin
发布于 2021-09-16 20:15
阅读 ( 4681 )

继“Venn图”之后的新秀“山峦图”

“Sangerbox云平台有交互式、可视化分析，无需会编程，只需将数据进行简单整理，点击鼠标，即可出图，快速便捷，很是厉害”

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柚子
发布于 2020-06-15 15:21
阅读 ( 4676 )

比较基因组学对进化和人类疾病的研究

比较基因组学的应用

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SXR
发布于 2017-04-17 09:37
阅读 ( 4637 )

Bioconda使用

### Conda包管理系统Conda是一种通用包管理系统，旨在构建和管理任何语言的任何类型的软件。通常与Anaconda (集成了更多软件包，[https://www.anaconda.com/download/#download](https://www.an...

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shengxinbaodian
发布于 2018-08-23 19:20
阅读 ( 4637 )

还找不到想要的文章吗？公众号搜索方法大全

随着公众号发展，历史文章越来越多，有很多小伙伴在查找某篇看过的文章、或想找相关的文章还是有困难的。检索的方法还是有很多的。大家常用的是人工查看历史消息，但历史过久或文章过多查找十...

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刘永鑫
发布于 2017-10-25 14:00
阅读 ( 4623 )

宏基因组扩增子统计绘图大全：中文首发,最详系,零基础(箱线图、散点图、热图、曼哈顿图、火山图、韦恩图、三元图、网络图)

本网对Markdown排版支持较差，对格式不满意的用户请跳转至或“宏基因组”公众号阅读；注：文为蓝色字均为文章链接，可点击直达写在前面优秀的作品都有三部分曲，如骇客帝国、教父、指环...

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刘永鑫
发布于 2017-10-13 20:09
阅读 ( 4617 )

当在文献中看到一个GEO数据集却在GEO中没有权限下载的时候，应该想到ArrayExpress

今日看文献，发现了一套关于疼痛的数据集GSE69901，诚然在GEO中检索时是长这样的：实在是对该数据集有点兴趣，所以在pubmed上搜索了一下这个数据集：从文献上来看并不是同一个作者的，那么...

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祝让飞
发布于 2019-03-07 13:59
阅读 ( 4613 )

Endnote X8云同步：家里单位实时同步文献笔记，有网随时读文献

本文适合已经在使用Endnote X8的用户。什么？你连软件都没用过，赶快后台回复“endnote”下载最新版。基本操作也不会用吗？

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刘永鑫
发布于 2017-10-13 11:55
阅读 ( 4591 )

TCGA RNA测序ID转换一文就够

“为了解决在使用TCGA数据做数据分析时各种数据转化问题，话不多说直接看教程，干货满满”

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柚子
发布于 2020-06-15 15:17
阅读 ( 4590 )

重组腺病毒8大优点

1 、宿主范围广，对人致病性低这套腺病毒载体系统可广泛用于人类及非人类蛋白的表达。腺病毒可感染一系列哺乳动物细胞，因此在大多哺乳动物细胞和组织中均可用来表达重组蛋白。 2、在增殖和非增殖细胞中感染和表达基因逆转录病毒只能感染增殖性细胞，因此 DNA 转染不能在非增殖细胞中进行，而必须使细胞处于持续培养状态。腺病毒则能感染几乎所有的细胞类型，除了一些抗腺病毒感染的淋巴瘤细胞。腺病毒是研究原代非增殖细胞基因表达的最佳系统，它可以将转化细胞和原代细胞中得到的结果直接进行对比。

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辉骏生物
发布于 2018-11-22 13:43
阅读 ( 4580 )

生信分析云平台产品开发 - 4 生信分析pipeline图形化

变量处理：要实现pipeline图形设计器，首先要先对用到的变量，做统一的设计分析步骤/节点设计：前文提到，生信分析pipeline其实就是基于文件输入输出的工作流，这里对工作流做了简化，归纳起来工作流中有4种节点。工作流设计：最后，有了变量，和节点，最后就是工作流的设计了。用连接线，将以上4中节点连接起来，计算相互之间的依赖关系，用统一的格式保存起来。