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单细胞测序教程

小伙伴们，大家好，今天我们来开启一个新的话题，Single cell sequence，近来单细胞测序在探索生物过程、疾病机理等方面展现了前所未有的精度，通过对单细胞进行 DNA 和 RNAseq 我们得以高精度的了解单个细胞水平的体细胞突变情况，并且对于一个样本中细胞类型的组成和解析获得空前的认识。

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生信分析流
发布于 2019-09-05 15:24
阅读 ( 3896 )

数据挖掘系列二开篇如何构建CeRNA

TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类；ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。本讲非常详细解读基本TCGA数据库为后续分析打下一个坚实基础。

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调研图
发布于 2018-11-16 11:14
阅读 ( 3882 )

生信分析云平台产品开发 - 4 生信分析pipeline图形化

变量处理：要实现pipeline图形设计器，首先要先对用到的变量，做统一的设计分析步骤/节点设计：前文提到，生信分析pipeline其实就是基于文件输入输出的工作流，这里对工作流做了简化，归纳起来工作流中有4种节点。工作流设计：最后，有了变量，和节点，最后就是工作流的设计了。用连接线，将以上4中节点连接起来，计算相互之间的依赖关系，用统一的格式保存起来。

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豆浆包子
发布于 2019-09-19 13:23
阅读 ( 3878 )

孟德尔随机化之因果推断的假设（一）

在前几期的内容中，我反复强调孟德尔随机化得出的是“因果”推论。在今天这一期中，我将重点阐明这种“因果推断”的含义。同时，我还将对工具变量理论进行了更详细的解释，并用生物学

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米老鼠
发布于 2020-09-13 23:21
阅读 ( 3877 )

宏基因组扩增子统计绘图大全：中文首发,最详系,零基础(箱线图、散点图、热图、曼哈顿图、火山图、韦恩图、三元图、网络图)

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刘永鑫
发布于 2017-10-13 20:09
阅读 ( 3873 )

还找不到想要的文章吗？公众号搜索方法大全

随着公众号发展，历史文章越来越多，有很多小伙伴在查找某篇看过的文章、或想找相关的文章还是有困难的。检索的方法还是有很多的。大家常用的是人工查看历史消息，但历史过久或文章过多查找十...

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刘永鑫
发布于 2017-10-25 14:00
阅读 ( 3862 )

文献解读（2）通过膀胱癌肿瘤突变负荷和免疫治疗的关系来进行多组学分析

结合TCGA数据库中膀胱癌的体细胞突变数据计算病人的TMB值，基于该值的中位数值将样本划分为高TMB组合低TMB组，首先刻画高低TMB组生存的差异；接下来，结合膀胱癌病人的表达谱数据，识别高低TMB组差异的基因，使用单因素和多因素cox回归分析进而结合构建了由8个基因组成的膀胱癌预后模型；考虑到TMB值和免疫治疗的关系，使用CIBERSORT软件对膀胱癌病人中22中免疫细胞的组成刻画，基于单因素cox回归分析，找到潜在影响病人生存的免疫细胞类。