文章 - 第5页 - 生信人

TCGA下载工具超级版，在线秒下载

终于TCGA数据下载的终结版上线了，下载地址如：http://sangerbox.com/TcgaDown 界面沿用了之前的风格，一张图秒懂：每种数据类型下载到个人中心后可以看到合并的数据和单个的原始TCGA下...

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祝让飞
发布于 2020-04-16 20:40
阅读 ( 4932 )

在GEO数据库如何找带有预后信息的数据？一分钟搞定，适用于找任何的样本特征数据

GEO数据库是目前基因表达谱数据数据库之一、里面包含了各种物种的各种测序和芯片平台的数据。详情介绍可以参考这篇文章：https://shengxin.ren/article/454，在这里我们主要介绍怎么快速的获取 ...

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祝让飞
发布于 2020-02-07 10:32
阅读 ( 14586 )

怎样使用SangerBox进行投稿选刊

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祝让飞
发布于 2019-12-17 15:16
阅读 ( 3328 )

怎样使用Sangerbox对搜索结果进行统计

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祝让飞
发布于 2019-12-17 15:15
阅读 ( 1955 )

怎样利用Sangerbox收藏文献，高效读文章

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祝让飞
发布于 2019-12-17 15:07
阅读 ( 1781 )

怎么高效的使用Sangerbox查文献

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祝让飞
发布于 2019-12-17 15:05
阅读 ( 2352 )

如何快速的查询某学者的基金项目列表

用Sangerbox公众号，便捷快速。近日公众号上线了新功能，可以根据人名或者人名+单位就能检索此人的所有基金项目哦此外还能预测与此人的亲密合作伙伴呢

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祝让飞
发布于 2019-12-13 11:07
阅读 ( 18689 )

你知道桑格组手公众号怎么查询即时影响因子了吗

好久没有更新公众号的杂志影响因子查询的功能了，最近做了一下改版，主要有两个方面： 1、优化了搜索方式，之前是需要输入完整的杂志名称才能查影响因子及分区，现在支持模糊搜索啦，比如搜索p...

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祝让飞
发布于 2019-11-26 20:00
阅读 ( 89033 )

如何在 Linux 中查看目录大小？

这是一篇关于如何通过一些常用的命令，显示 CentOS 或 RedHat 中的 Linux 目录大小，以及哪些文件夹占用的空间最大的教程。搜索当前的 CentOS 或 RedHat 文件夹您可以使用以下命令，在命令行中??

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史提芬先森
发布于 2019-11-26 14:06
阅读 ( 2058 )

图形化开放式生信分析云平台产品开发 - 7 分析报告的模板定制与自动生成

分析报告的模板定制与自动生成

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豆浆包子
发布于 2019-10-22 18:39
阅读 ( 2255 )

生信分析云平台产品开发 - 6 生信分析pipeline批量运行与过程控制

一、分析流程的批量运行顺序二、分析流程的过程控制

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豆浆包子
发布于 2019-10-14 12:28
阅读 ( 2599 )

生信分析云平台产品开发 - 5 生信分析pipeline服务器端运行

前文链接：图形化生物信息分析系统开发 - 1 需求分析及技术实现图形化生物信息分析系统开发 - 2 样本信息处理图形化生物信息分析系统开发 - 3 生信分析pipeline的进化图形化生物信息分...

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豆浆包子
发布于 2019-09-27 14:23
阅读 ( 2238 )

生信分析云平台产品开发 - 4 生信分析pipeline图形化

变量处理：要实现pipeline图形设计器，首先要先对用到的变量，做统一的设计分析步骤/节点设计：前文提到，生信分析pipeline其实就是基于文件输入输出的工作流，这里对工作流做了简化，归纳起来工作流中有4种节点。工作流设计：最后，有了变量，和节点，最后就是工作流的设计了。用连接线，将以上4中节点连接起来，计算相互之间的依赖关系，用统一的格式保存起来。

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豆浆包子
发布于 2019-09-19 13:23
阅读 ( 3891 )

生信分析云平台产品开发 - 3 生信分析pipeline的进化

接上两篇内容，本文主要讲述工作中NGS从科研进入医学临床领域，工作中接触到生信流程，以及最终在自动图形化开放式生信分析系统开发中生信workflow设计实现的过程。 1.手动命令行运行 2. 脚本连续运行 3.一个脚本 shell 文件运行整个分析流程 4. 自动扫描文件并运行脚本 5. 带报告的自动扫描并触发运行脚本

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豆浆包子
发布于 2019-09-09 18:19
阅读 ( 4344 )

生信分析云平台产品开发 - 2样本信息处理

生信分析云平台开发 - 2样本信息处理

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豆浆包子
发布于 2019-08-28 23:10
阅读 ( 3184 )

生信分析云平台产品开发 - 1简单需求分析及技术实现

我的生信生产系统/全自动分析系统开发过程- 1简单需求分析及技术实现起因/背景几张图片实践问题一，图形化替代命令行脚本交互实践问题二，解决迁移部署问题实践问题三，解决环境搭建、软件安装问题需求：分析流程（pipeline）能够快速部署迁移技术实现：使用虚拟化技术：最终软件架构设计如图：自动运行结构如图（针对Illumina机型）：