第三篇lncRNA signature的文章解析，IF五分胶质瘤
这是一篇比较老的建模的文章，发表在Neurobiology of Disease上，目前影响因子五分多点。 Long non-coding RNA expression profiles predict clinical phenotypes in glioma 本文从lncRNA...
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- 祝让飞
- 发布于 2018-10-09 17:06
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祝让飞
胶质瘤免疫治疗高分文章赏析
首先祝大家圣诞节快乐！ 今天不废话直接看文章。 一篇来自发表于神经医学一线期刊《 Neurology》（IF=7.609）的文章。 （在本公众号输入 30171077 可下载该文章全文预览) 胶质瘤
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- 生信分析流
- 发布于 2018-12-26 14:13
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生信分析流
森林图快速绘制工具——既不要编程又能直观的展示cox比例分析结果的工具来了！
1. 如果是以文件的格式将数据导入到云平台，平台默认无法读取Excel中的数据，必须将Excel文件转为以制表位符分割的文本文件，否则小工具将无法运行。 2. 森林图不仅能展示单因素cox比例分险结果，同样能展示多因素cox比例分险结果
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- 柚子
- 发布于 2020-05-26 09:25
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柚子
八种免疫浸润评分的简易计算工具
肿瘤免疫已经是热点中的热点，逐渐成为数据分析中的标准分析了，在这里我们封装了八种常见的免疫微环境评分的计算方法，界面非常简单，输入的是表达谱矩阵，行为基因，列为样本。 使用该工具是...
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- admin
- 发布于 2021-07-23 10:50
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admin
limma快速差异分析工具！
limma包是2015年发表在Nucleic Acids Resarch一个做差异分析的工具，目前引用次数高达七千多次。Limma包是基于voom的算法，它既可以对芯片数据进行差异分析，也可以对转录组高通量测序数据进行差异分析。
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- 柚子
- 发布于 2020-05-26 11:53
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宏基因组扩增子1图表解读-理解文章思路，零基础测序分析图表解读大全(箱线,散点,热,曼哈顿,火山,韦恩,三元,网络)，老板再也不愁我的文献阅读了!
本网内容转载自“宏基因组”公众号，更佳阅读体验、更多相关文章，欢迎点我跳转至公众号。 写在前面 (Introduction) 很多刚接触高通量测序数据分析文章的学生，感觉图表丰富多样高大上，但...
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- 刘永鑫
- 发布于 2018-02-01 18:36
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刘永鑫
植物MWAS研究—谷子产量与微生物组关联分析
本文内容首发植物微生物组公众号，更多阅读欢迎跳转植物微生物组公众号 MWAS简介 微生物组关联分析(Microbiome/Metagenome-wide association studies , MWAS)是指捕获多维尺度上的互作作用，...
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- 刘永鑫
- 发布于 2017-10-13 11:59
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孟德尔随机化之研究背景
久违的孟德尔随机化开始更新了，在今天的内容中，我将向大家介绍孟德尔随机化的基本概念及其背景知识，并举例说明何时可以使用该方法以及该方法为何能有效解释因果关系。本系列讲解内
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- 米老鼠
- 发布于 2020-09-13 23:17
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米老鼠
最新5+套路：免疫基因对已成过去式，新的对子再次出发！细胞与细胞相互作用换个角度看肿瘤预后
说起了小编很感慨，在19年的时候我们推出了免疫基因对的思路，并且当时做了好些个大肿瘤，伴随着早先的文章见刊，后面被录成了套路视频，各种层出不穷的基因对如火山般的爆发，尽管这个套路我们...
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- admin
- 发布于 2021-10-18 14:29
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文献解读（4）NC甲状腺癌的刻画
在这项研究中，作者使用不同类型的测序技术，刻画了ATC和DTCs的基因组和转录组景观。使用突变谱证实了之前的描述，多次基因改变促进了TC的进展。此外，作者采用多种分析方法刻画了TCs转录组特征。
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- 柚子
- 发布于 2019-12-13 17:37
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DNA甲基化测序方法介绍
DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分，在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用，是目前新的研究热点之一。 DNA 甲基化及CpG岛 DNA 甲基化是最
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- 祝让飞
- 发布于 2018-08-20 17:07
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辉骏生物
零代码系列之三教你如何进行功能富集
上一节课讲解如果使用工具盒中一键式WGCNA软件并且找到共表达模块，那么接下来我们看下如何获取目标模块基因集，已经目标模块的具体有哪些功能。1、功能模块基因获取；2、在线富集分析操作步骤；3、富集结果两种可视化方法。
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- 调研图
- 发布于 2018-12-10 16:14
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调研图
一键计算泛癌中基因表达与肿瘤干性指数的关系
众所周知，现阶段研究肿瘤基本离不开TCGA,研究单个基因的话更离不开单个基因在泛癌中的表达，当然我们也可以分析 肿瘤细胞干性与基因表达的关系，我们从先前的研究中（Machine Learning Identif...
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- admin
- 发布于 2021-10-07 12:06
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两篇文章一字之差，影响因子差了三倍，他们都干了啥？（第一篇）
话不多说先上图： 最近在写工具盒里WGCNA工具的使用教程，检索素材时发现了一篇文章，哦不，是两篇，他们长的几乎一样，且看：Prognostic Genes of Breast Cancer Identified by Gene Co-exp...
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- 祝让飞
- 发布于 2018-10-16 16:19
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支持两千多个芯片平台的简易ID转换工具
基因ID转换是做数据分析过程中最常见的工作，在这里我们整理了两千多个基因芯片平台的注释基因，利用genecard 进行了统一的匹配，提供了一个简易的ID转换工具。简易的输入界面： 点击 开始分...
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- admin
- 发布于 2021-11-08 21:21
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孟德尔随机化之因果推断的假设（二）
3.2 查找有效的工具变量 工具变量（IV ）技术是可用于估算因果效应的几种方法之一，而无需完全了解所有可能影响暴露- 结局??
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- 米老鼠
- 发布于 2020-09-13 23:22
- 阅读 ( 4474 )
