热门的文章 - 第22页

转录组Count数据差异分析工具

当我们拿到表达谱数据之后，做差异分析之前，有两个关键信息需要确认，一个是数据类型（芯片数据、FPKM、TPM、Count）,一个是哪些样本作为参照物，哪些样本作为处理组样本，也就是谁相对于...

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admin
发布于 2021-08-19 11:40
阅读 ( 5303 )

两篇文章一字之差，影响因子差了三倍，他们都干了啥？（第一篇）

话不多说先上图：最近在写工具盒里WGCNA工具的使用教程，检索素材时发现了一篇文章，哦不，是两篇，他们长的几乎一样，且看：Prognostic Genes of Breast Cancer Identified by Gene Co-exp...

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祝让飞
发布于 2018-10-16 16:19
阅读 ( 5278 )

欧洲银桦基因组登上Nature genetics！

最近随着三代测序的火热，纯三代的基因组文章也遍地开花！技术的提升必然带来的基因组质量的提升，但是对做研究而言，最终还是得落到物种自身。下面这篇文章告诉你，没有熊猫血，怎么关注爆表。...

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百迈客
发布于 2017-05-16 17:50
阅读 ( 5274 )

箱线图快速绘制工具

“原来需要大半天才能做出一个图，现在的小工具几分钟就可以搞定，关键还是高颜值，棒棒的！”

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柚子
发布于 2020-05-26 09:30
阅读 ( 5269 )

两篇胃癌lncRNA signature文章解读之二（IF=3.2）

这是一篇2017年的文章，文章从lncRNA的角度筛选lncRNA signature，该文章发表在Journal of Cancer上，影响因子如下：文章题目为：Differentially Expressed lncRNAs in Gastric Cancer Patien...

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祝让飞
发布于 2018-10-09 09:06
阅读 ( 5259 )

肿瘤是由良性和恶性细胞组成的复杂混合物，这两类细胞共同构成了相互关联的肿瘤微环境。在肿瘤研究中，只有分析多个细胞群的组合才能去真正了解肿瘤临床表型的进展和起源。在这篇文章中，作者去刻画了组织样本、分解后的肿瘤细胞和正常细胞之间mRNA丰度的关联，发现使用分解后的肿瘤细胞mRNA表达谱较组织样本的mRNA表达谱去对肿瘤进行研究，前者能识别更鲁棒的基因标志物。总结来说，就是通过计算机模拟分解的肿瘤细胞和正常细胞mRNA表达有利于肿瘤之间复杂的转录网络、微环境和癌症侵袭的研究。

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柚子
发布于 2019-11-25 18:46
阅读 ( 5258 )

纯三代向日葵基因组登上Nature

看见文章小编只能说“又一个基因组被纯三代测序组装给攻克了”，吃瓜子群众看好了！研究背景向日葵是重要的经济作物，其地位，小编不阐述了。想象一下，闲来无事，看看电视，嗑嗑瓜子是...

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百迈客
发布于 2017-05-25 07:26
阅读 ( 5239 )

宏基因组-扩增子分析流程：中文首发,史上最详系,零基础自学

本系统文章叫分析解读，即有详细的扩增子分析流程代码，又有本人对使用参数、备选参数意义的解读，可以让大部分人零基础学习并理解数据分析过程，并可亲自实践在自己的课题上，获得更好、更合理的实验结果。

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刘永鑫
发布于 2017-10-13 20:08
阅读 ( 5238 )

Cluster3.0软件使用教程

先填坑先填坑先填坑先填坑先填坑先填坑

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祝让飞
发布于 2018-04-04 21:55
阅读 ( 5229 )

视频教程：R语言recharts包绘制交互式图形

写在前面你见过随月份变化的温度拆线图你还见过可以鼠标点选显示详细信息、开关分组的散点图互联网中铺天盖地的词云线图、柱状图、堆叠图任意切换，不再为选择类型纠结甚至...

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刘永鑫
发布于 2018-02-07 14:16
阅读 ( 5218 )

分享一段比较不同模型的C-index和RMS的代码

已封装成函数，如下： compareRiskModal=function(os,ev,risks){ library('survRM2') library('Hmisc') require(survival) library(survcomp) library(prodlim) os=data$SURVIVAL_...

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祝让飞
发布于 2019-11-12 15:16
阅读 ( 5208 )

简易森林图绘制工具

这是一款非常简单的森林图绘制工具，和用Excel一样进行绘图，此外通过控制行高和列高可以很方便的进行绘图时的单行高度和宽度调整标准的可视化图如下：几种小技巧 1、通过改变行...

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admin
发布于 2021-06-16 16:34
阅读 ( 5184 )

png如何转为svg格式：R语言

分分钟换成高清大图

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SXR
发布于 2017-04-07 09:51
阅读 ( 5183 )

cBioportal (含TCGA)数据的分组与下载

TCGA基因表达的数据分组、数据下载

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weilong
发布于 2023-02-01 13:21
阅读 ( 5168 )

CeRNA终篇-生存分析优化CeRNA网络

TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类；ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。作为本系列的最后一讲，给大家介绍工具盒中批量生存分析和MRE统计算法，对ceRNA网络进行最后优化。

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调研图
发布于 2018-11-16 17:30
阅读 ( 5158 )

存在cdf文件的芯片数据，但没有R包构建R包并安装cdf

关键命令： BiocManager::install('makecdfenv') library(makecdfenv) make.cdf.package("GPL15048_HuRSTA_2a520709.CDF.gz", "hursta2a520709cdf", species = "Homo sapiens", compress = T...