热门的文章 - 第23页

分享一段比较不同模型的C-index和RMS的代码

已封装成函数，如下： compareRiskModal=function(os,ev,risks){ library('survRM2') library('Hmisc') require(survival) library(survcomp) library(prodlim) os=data$SURVIVAL_...

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祝让飞
发布于 2019-11-12 15:16
阅读 ( 6052 )

胶质瘤免疫治疗高分文章赏析

首先祝大家圣诞节快乐！今天不废话直接看文章。一篇来自发表于神经医学一线期刊《 Neurology》（IF=7.609）的文章。（在本公众号输入 30171077 可下载该文章全文预览) 胶质瘤

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生信分析流
发布于 2018-12-26 14:13
阅读 ( 6049 )

如何做一个发表级的单基因在泛癌中基因组突变表达差异分析

众所周知，现阶段研究肿瘤基本离不开TCGA,研究单个基因的话更离不开单个基因在泛癌中的表达，当然我们也可以分析基因组变异与基因表达的关系在这里我们介绍一个傻瓜式的工具助你高效的分析，...

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admin
发布于 2021-09-30 14:24
阅读 ( 6047 )

Python Schema使用说明

Python Schema一种优雅的数据验证方式

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deepxin
发布于 2017-10-30 14:27
阅读 ( 6043 )

宏基因组扩增子1图表解读-理解文章思路，零基础测序分析图表解读大全(箱线,散点,热,曼哈顿,火山,韦恩,三元,网络)，老板再也不愁我的文献阅读了!

本网内容转载自“宏基因组”公众号，更佳阅读体验、更多相关文章，欢迎点我跳转至公众号。写在前面 (Introduction) 很多刚接触高通量测序数据分析文章的学生，感觉图表丰富多样高大上，但...

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刘永鑫
发布于 2018-02-01 18:36
阅读 ( 6040 )

Nature综述|整合组学分析护航健康，推动精准医学时代的到来！

导读 Konrad J. Karczewski, and Michael P. Snyder 撰写的关于整合多组学在疾病研究中的应用一文《Integrative omics for health and disease》，于 2018年2月26日发表在 nature reviews genetics (Nature系列综述, 2018

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shengxinbaodian
发布于 2018-10-26 17:58
阅读 ( 5996 )

植物根际微生物组也有昼夜节律

植物根际微生物组存在昼夜节律文章2017年6月发表在Microbiome上，与2016年Cell发表《微生物组昼夜节律影响宿主转录组波动》的小鼠文章思路相似，但材料原创。摘要背景昼夜节律调控植物...

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刘永鑫
发布于 2018-04-04 23:57
阅读 ( 5996 )

生信分析云平台产品开发 - 1简单需求分析及技术实现

我的生信生产系统/全自动分析系统开发过程- 1简单需求分析及技术实现起因/背景几张图片实践问题一，图形化替代命令行脚本交互实践问题二，解决迁移部署问题实践问题三，解决环境搭建、软件安装问题需求：分析流程（pipeline）能够快速部署迁移技术实现：使用虚拟化技术：最终软件架构设计如图：自动运行结构如图（针对Illumina机型）：

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豆浆包子
发布于 2019-08-21 17:19
阅读 ( 5994 )

孟德尔随机化之因果推断的假设（一）

在前几期的内容中，我反复强调孟德尔随机化得出的是“因果”推论。在今天这一期中，我将重点阐明这种“因果推断”的含义。同时，我还将对工具变量理论进行了更详细的解释，并用生物学

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米老鼠
发布于 2020-09-13 23:21
阅读 ( 5979 )

CeRNA终篇-生存分析优化CeRNA网络

TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类；ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。作为本系列的最后一讲，给大家介绍工具盒中批量生存分析和MRE统计算法，对ceRNA网络进行最后优化。

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调研图
发布于 2018-11-16 17:30
阅读 ( 5961 )

从零到壹：用云服务器分析转录组每个样本只要十元的教程

真的只要十元

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娄佳成
发布于 2018-01-18 16:07
阅读 ( 5952 )

零代码系列之三教你如何进行功能富集

上一节课讲解如果使用工具盒中一键式WGCNA软件并且找到共表达模块，那么接下来我们看下如何获取目标模块基因集，已经目标模块的具体有哪些功能。1、功能模块基因获取；2、在线富集分析操作步骤；3、富集结果两种可视化方法。

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调研图
发布于 2018-12-10 16:14
阅读 ( 5940 )

4分+纯生信分析：免疫结合病毒如何实现抗肿瘤作用

大家好, 今天和大家分享的是 2020 年 4 月发表在Biomed Pharmacother(IF:4.545)上的一篇文章，作者通过网络药理学结合生物信息学方法，分析了传统中药——家蚕对于肝癌的药理机制。标题：Study on th

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生信分析流
发布于 2020-07-07 14:25
阅读 ( 5939 )

CeRNA网络美化篇

TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类；ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。本节主要通过相关性优化ceRNA网络，去除大量假阳性位点。

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调研图
发布于 2018-11-16 16:14
阅读 ( 5862 )

开怼：我免费提供单基因泛癌分析，你抄袭录个视频收费一千？那我也录套视频免费送！

我们整理了所有的TCGA数据，计算了所有的免疫微环境、微卫星不稳定性等等多种特征，整理了所有的临床信息，建立了一个傻瓜式的单基因泛癌分析工具，做到一键出图，并且是毫无保留的矢量图呢，并且还配了视频讲解视频https://www.bilibili.com/video/BV1s7411P7fS/：工具链接：http://sangerbox.com/AllTools?tool_id=9697971