热门的文章 - 第18页

用公共数据发文章-基因家族分析好思路

利用公共数据发文章，基因家族好思路。虽然我们一直在说可以“用别人的数据，写自己的文章”，但是具体怎么操作，很多同学还是不清楚。今天就用一个完全用公共数据库资源进行分析发文的例子来和大家分享下这方面的思路。

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组学生物
发布于 2018-07-13 10:01
阅读 ( 7697 )

扩增子分析神器USEARCH简介

本文中引用统计采用Google学术，统计日期截止2017年10月9日。 Usearch简介主页：http://www.drive5.com/usearch/ Usearch是什么？它是超快的序列分析软件，在序列比对、聚类、操作等多领域...

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刘永鑫
发布于 2017-10-12 23:01
阅读 ( 7691 )

快速上手的中文版GSEA工具！

为了解决四个难题我们设计开发了“GSEA简易分析工具”和” GSEA结果可视化工具”

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柚子
发布于 2020-06-15 14:53
阅读 ( 7679 )

微生物多样性分析神器Qiime的centos 6.7的安装历程

QIIME （Quantitative Insights Into Microbial Ecology）是一个专门针对于微生物群落的分析pipline，可以进行OTU,以及多样性分析等等。拥有处理16s rRNA所需要的软件并呈现相应的处理结果。所谓分析pipline必是集成软件，QIIME也不例外。因此安装起来超级麻烦。

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祝让飞
发布于 2017-05-26 21:39
阅读 ( 7669 )

Genewise预测假基因的注意事项

1、genewise简介 Genewise软件是大家在基因组项目中经常用到的软件，可能主要用也基因预测和假基因预测。基因预测以往的文章都提及过，对于假基因预测这部分，也说过，但是总觉得有一些注...

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SXR
发布于 2017-03-30 21:36
阅读 ( 7667 )

用TCGA数据不用编程轻轻松松构建CeRNA网络

TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类；ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。

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调研图
发布于 2018-11-23 18:02
阅读 ( 7662 )

mongodb内存占用过高可行的限制办法

最近服务器卡的要死，后来发现是用来MongoDB在后台建索引，占了一半的内存，MongoDB本身是一个极耗内存的数据库，你有多少内存他都能吃进去，谷歌之后寻到解决办法如下：服务器系统是CentOS7...

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祝让飞
发布于 2018-12-27 08:40
阅读 ( 7662 )

两篇胃癌lncRNA signature文章解读之一（IF=7.7）

这是一篇2016年的文章，文章从lncRNA的角度筛选lncRNA signature，该文章发表在Molecular Cancer上，影响因子如下：下面我们一起来解析一下这篇文章文章标题如：看signature大体思路...

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祝让飞
发布于 2018-10-08 21:01
阅读 ( 7654 )

央视与遗传发育所合拍《走进科学-小菌株大作为》——枯草芽孢杆菌替代畜牧业抗生素添加

我国是世界上最大的抗生素生产和使用国，同时也是细菌耐药性的重灾区。抗生素滥用问题在医疗特别是畜牧业领域尤其严重。畜牧业养殖户普遍将饲用抗生素添加到饲料中，当做保健品给动物防病，促...

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刘永鑫
发布于 2018-03-25 22:20
阅读 ( 7630 )

SesameFG：芝麻功能基因组学的综合数据库

SesameFG为芝麻功能基因组学研究和分子育种提供了宝贵的资源和工具

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调研图
发布于 2017-11-06 21:05
阅读 ( 7597 )

What？PC跑转录组。

What？PC跑转录组。简介上次小编介绍了如何利用生信人小工具进行芯片数据的处理。但是相信大家有些时候还是需要从转录组数据开始的。应用场景：比如之前的数据大家只是对编码的基因进...

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张海伦
发布于 2017-10-23 17:09
阅读 ( 7593 )

肿瘤研究不能不知道的TCGA数据库挖掘工具大全，TCGA再也不愁！

TCGA数据库的挖掘工具层出不穷，从数据下载到数据挖掘，这里小编给大家整理一份官网的数据挖掘工具大全： http://www.cancerimagingarchive.net/ The Cancer Imaging Archive (TCIA) TCIA存储...

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余繁荣
发布于 2019-03-21 12:36
阅读 ( 7568 )

收藏|已公布的三代全长转录组数据

目前已发表的三代全长转录组数据。

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张海伦
发布于 2017-07-26 09:27
阅读 ( 7560 )

文献解读（3）在AML中是否存在RNA剪切差异？

发表期刊：Clinical Cancer Research 发表日期：2020 Mar 2. 影响因子：8.91 DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-20-0184

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柚子
发布于 2020-06-15 15:51
阅读 ( 7558 )

生信文章解析（第一篇）在乳腺癌中，MAPK通路的突变驱动扰动与肿瘤内免疫反应负相关？

基于免疫相关基因对乳腺癌样本重新划分具有不同免疫表型的病人，从多组学的角度刻画这些不同免疫表型病人的特征。

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柚子
发布于 2019-07-30 10:21
阅读 ( 7511 )

如何解决生信新手分析时常常遇到的数据问题

参考文献 Wagner, G.P., Kin, K. & Lynch, V.J. Measurement of mRNA abundance using RNA-seq data: RPKM measure is inconsistent among samples. Theory Biosci. 131, 281–285 (2012).