水稻微生物组时间序列分析
中科院遗传发育所揭示水稻全生育期根系微生物组的变化规律图文详解水稻根系微生物随时间变化吗？微生物组随时间变化的规律哪些菌门随时间呈现规律变化呢?哪些菌可以作为生育时间的biomarkers?猜...
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- 刘永鑫
- 发布于 2018-04-10 21:13
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刘永鑫
两篇胃癌lncRNA signature文章解读之一（IF=7.7）
这是一篇2016年的文章，文章从lncRNA的角度筛选lncRNA signature，该文章发表在Molecular Cancer上，影响因子如下： 下面我们一起来解析一下这篇文章 文章标题如： 看signature大体思路...
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- 祝让飞
- 发布于 2018-10-08 21:01
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祝让飞
用TCGA数据不用编程轻轻松松构建CeRNA网络
TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类；ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。
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- 调研图
- 发布于 2018-11-23 18:02
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调研图
cyn-111
用公共数据发文章-基因家族分析好思路
利用公共数据发文章，基因家族好思路。 虽然我们一直在说可以“用别人的数据，写自己的文章”，但是具体怎么操作，很多同学还是不清楚。今天就用一个完全用公共数据库资源进行分析发文的例子来和大家分享下这方面的思路。
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- 组学生物
- 发布于 2018-07-13 10:01
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组学生物
百迈客
央视与遗传发育所合拍《走进科学-小菌株大作为》——枯草芽孢杆菌替代畜牧业抗生素添加
我国是世界上最大的抗生素生产和使用国，同时也是细菌耐药性的重灾区。抗生素滥用问题在医疗特别是畜牧业领域尤其严重。畜牧业养殖户普遍将饲用抗生素添加到饲料中，当做保健品给动物防病，促...
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- 刘永鑫
- 发布于 2018-03-25 22:20
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肿瘤研究不能不知道的TCGA数据库挖掘工具大全，TCGA再也不愁！
TCGA数据库的挖掘工具层出不穷，从数据下载到数据挖掘，这里小编给大家整理一份官网的数据挖掘工具大全： http://www.cancerimagingarchive.net/ The Cancer Imaging Archive (TCIA) TCIA存储...
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- 余繁荣
- 发布于 2019-03-21 12:36
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余繁荣
Bryce
SesameFG：芝麻功能基因组学的综合数据库
SesameFG为芝麻功能基因组学研究和分子育种提供了宝贵的资源和工具
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- 调研图
- 发布于 2017-11-06 21:05
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张海伦
柚子
What？PC跑转录组。
What？PC跑转录组。 简介 上次小编介绍了如何利用生信人小工具进行芯片数据的处理。但是相信大家有些时候还是需要从转录组数据开始的。 应用场景：比如之前的数据大家只是对编码的基因进...
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- 张海伦
- 发布于 2017-10-23 17:09
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做富集分析不一定非得用R,结果依然秀色可餐
那么经过前面一系列的操作后，终于拿到我们需要的差异基因，下面就要开始这些差异基因的表演了，估计大家首先想到就是这些基因有一个什么功能，首选就是KEGG和GO富集分析，目前大家常用的是...
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- 调研图
- 发布于 2018-06-15 20:11
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生信文章解析（第一篇）在乳腺癌中，MAPK通路的突变驱动扰动与肿瘤内免疫反应负相关？
基于免疫相关基因对乳腺癌样本重新划分具有不同免疫表型的病人，从多组学的角度刻画这些不同免疫表型病人的特征。
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- 柚子
- 发布于 2019-07-30 10:21
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实战系列（一）手把手复现3分lncRNA经典小文章
DOI ： 10.1080/21691401.2017.1366334 17年发表的与肺鳞癌预后相关的lncRNA研究，影响因子3.026 此篇相对有点早，但是作为一个标准，如果不能完成这样的一个研究，想做近期热点的免疫研究是很难
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- 生信分析流
- 发布于 2019-07-10 09:47
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生信分析流
文献解读（3）在AML中是否存在RNA剪切差异？
发表期刊：Clinical Cancer Research 发表日期：2020 Mar 2. 影响因子：8.91 DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-20-0184
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- 柚子
- 发布于 2020-06-15 15:51
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TCGA下载工具超级版，在线秒下载
终于TCGA数据下载的终结版上线了，下载地址如：http://sangerbox.com/TcgaDown 界面沿用了之前的风格，一张图秒懂： 每种数据类型下载到个人中心后可以看到 合并的数据 和 单个的原始TCGA下...
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- 祝让飞
- 发布于 2020-04-16 20:40
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辉骏生物
如何解决生信新手分析时常常遇到的数据问题
参考文献 Wagner, G.P., Kin, K. & Lynch, V.J. Measurement of mRNA abundance using RNA-seq data: RPKM measure is inconsistent among samples. Theory Biosci. 131, 281–285 (2012).
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- 柚子
- 发布于 2020-06-15 15:03
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