热门的文章 - 第18页

如何解决生信新手分析时常常遇到的数据问题

参考文献 Wagner, G.P., Kin, K. & Lynch, V.J. Measurement of mRNA abundance using RNA-seq data: RPKM measure is inconsistent among samples. Theory Biosci. 131, 281–285 (2012).

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柚子
发布于 2020-06-15 15:03
阅读 ( 7788 )

Nature：如何做一篇肠道菌群免疫的顶级文章

本文转载自“科研小榴莲”，己获授权。今天小榴莲和大家一起探讨一篇17年十一月份发表在Nature的文章。在西方以及中国部分地区高盐饮食是一种非常普遍的现象，高盐饮食已经成为高血压以及心...

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刘永鑫
发布于 2018-01-23 19:53
阅读 ( 7783 )

用公共数据发文章-基因家族分析好思路

利用公共数据发文章，基因家族好思路。虽然我们一直在说可以“用别人的数据，写自己的文章”，但是具体怎么操作，很多同学还是不清楚。今天就用一个完全用公共数据库资源进行分析发文的例子来和大家分享下这方面的思路。

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组学生物
发布于 2018-07-13 10:01
阅读 ( 7780 )

扩增子分析神器USEARCH简介

本文中引用统计采用Google学术，统计日期截止2017年10月9日。 Usearch简介主页：http://www.drive5.com/usearch/ Usearch是什么？它是超快的序列分析软件，在序列比对、聚类、操作等多领域...

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刘永鑫
发布于 2017-10-12 23:01
阅读 ( 7774 )

用TCGA数据不用编程轻轻松松构建CeRNA网络

TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类；ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。

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调研图
发布于 2018-11-23 18:02
阅读 ( 7756 )

保藏微生物菌种方法

各种微生物由于遗传特性不同，因此适合采用的保藏方法也不一样。一种良好的有效保藏方法，首先应能保持原菌种的优良性状长期不变，同时还须考虑方法的通用性、操作的简便性和设备的普及性。下面介绍几种常用的菌种保藏方法：

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辉骏生物
发布于 2018-11-28 15:08
阅读 ( 7756 )

两篇胃癌lncRNA signature文章解读之一（IF=7.7）

这是一篇2016年的文章，文章从lncRNA的角度筛选lncRNA signature，该文章发表在Molecular Cancer上，影响因子如下：下面我们一起来解析一下这篇文章文章标题如：看signature大体思路...

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祝让飞
发布于 2018-10-08 21:01
阅读 ( 7740 )

mongodb内存占用过高可行的限制办法

最近服务器卡的要死，后来发现是用来MongoDB在后台建索引，占了一半的内存，MongoDB本身是一个极耗内存的数据库，你有多少内存他都能吃进去，谷歌之后寻到解决办法如下：服务器系统是CentOS7...

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祝让飞
发布于 2018-12-27 08:40
阅读 ( 7739 )

Genewise预测假基因的注意事项

1、genewise简介 Genewise软件是大家在基因组项目中经常用到的软件，可能主要用也基因预测和假基因预测。基因预测以往的文章都提及过，对于假基因预测这部分，也说过，但是总觉得有一些注...

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SXR
发布于 2017-03-30 21:36
阅读 ( 7725 )

微生物多样性分析神器Qiime的centos 6.7的安装历程

QIIME （Quantitative Insights Into Microbial Ecology）是一个专门针对于微生物群落的分析pipline，可以进行OTU,以及多样性分析等等。拥有处理16s rRNA所需要的软件并呈现相应的处理结果。所谓分析pipline必是集成软件，QIIME也不例外。因此安装起来超级麻烦。