WGCNA 一键式分析工具
加权基因共表达网络分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis)是用来描述不同样品之间基因关联模式的系统生物学方法，可以用来鉴定高度协同变化的基因集, 并根据基因集的内连性和基...
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- admin
- 发布于 2021-08-28 12:06
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admin
双向电泳（2D电泳）实验技术
双向电泳(Two-dimensional electrophoresis)的基本原理是利用蛋白质的等电点（pI)和分子量(Mr)不同而分离蛋白质：第一向电泳——等电聚焦（Isoelectric Focusing，IEF）根据蛋白质的等电点不同将蛋白质分离，第二向电泳——十二烷基硫酸钠—聚丙烯酰胺凝胶电泳（Sodium Dodecyl Sulfate-Polyacrylamide Gel Electrophoresis, SDS—PAGE）利用蛋白质的分子量大小不同将蛋白质分离。
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- 辉骏生物
- 发布于 2018-11-27 15:55
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辉骏生物
TCGA简易下载工具V10更新
TCGA简易下载工具V10更新主要在于成熟体miRNA的数据合并上，支持miRNA的isoform合并，从中可以得到新的矩阵然后再使用便捷ID转换器就可以将miRNA的表达谱矩阵转换成-3p、5p的miRNA了
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- 祝让飞
- 发布于 2018-01-28 17:24
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祝让飞
更新了！多数据集合并及去除批次效应工具使用详解！
批次效应表示样品在不同批次中处理和测量产生的试验期间记录与任何生物变异无关的技术差异。
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- 柚子
- 发布于 2020-05-26 11:36
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柚子
miRNA与lncRNA的关系网络构建
TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类；ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。本节主要lncRNA与miRNA的关系对构建。
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- 调研图
- 发布于 2018-11-16 14:48
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调研图
五彩进化树与热图更配-ggtree美颜进化树(宏基因组扩增子)
研究基因功能的人建个树，需要找近缘物种、外类群十几至几十个物种，费N天的劲才能做个树。而宏基因组领域的人不用去收集其它物种，因为研究的对像本身就有几百到几千的物种，为了方便阅读或展示主要信息，我们反而会挑选结果中前100以内的物种去分析并展示。这是我们绝对的优势。
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- 刘永鑫
- 发布于 2017-10-13 20:05
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刘永鑫
SXR
简易矩阵操作工具使用教程
为了临床的童鞋更方便的处理大的表格矩阵，我们开发了一款简易的矩阵操作工具来对大的表格矩阵进行简单的数据处理 该简易矩阵操作工具主要包括以下几个功能： 1、从大的矩阵文件中提取指定列...
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- 祝让飞
- 发布于 2018-08-21 21:34
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根据芯片平台提供的基因组位置来提取基因
在做GEO数据挖掘的时候经常会遇到注释信息很老的芯片平台，或者有些芯片平台压根就没提供基因的注释信息，此时要使用这样的芯片着实不好办，我今天就遇到这样的一个芯片平台https://www.ncbi.nl...
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- 祝让飞
- 发布于 2018-09-03 10:09
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爽儿
全基因组重测序数据分析过程介绍
1. 简介(Introduction) 通过高通量测序识别发现de novo的somatic和germ line 突变，结构变异-SNV，包括重排突变（deletioin, duplication 以及copy number variation）以及SNP的座位；针对重排...
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- SXR
- 发布于 2017-04-05 09:56
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好用的在线GO富集分析工具
点击上方蓝字关注生信宝典，换个角度学生信。GeneOntology富集分析是高通量数据分析的标配，不管是转录组、甲基化、ChIP-seq还是重测序，都会用到对一个或多个集合的基因进行功能富集分析。
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- shengxinbaodian
- 发布于 2018-08-23 19:13
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shengxinbaodian
宏基因组实战4.基因注释Prokka
前情提要 如果您在学习本教程中存在困难，可能因为缺少背景知识，建议先阅读本系统前期文章 宏基因组分析理论教程微生物组入门圣经+宏基因组分析实操课程1背景知识-Shell入门与本地blast实战2...
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- 刘永鑫
- 发布于 2017-11-02 20:54
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ORCID 注册和使用
学术活动是一个连续的、长时间的活动，那么怎样才能将你的所有研究活动关联在一起呢？这里就需要用到一个【学术身份证】——即ORCID，你所有的国外投稿都是需要用到这样一个系统的，今天，小编就...
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- 祝让飞
- 发布于 2021-05-05 13:12
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张海伦
相关性矩阵热图绘制工具使用案例
在我们的组学研究中经常会遇到各种相关性，今天这款小工具专注解决各种矩阵相关性问题，老司机不多说赶紧上车 软件界面如下： 一目了然，输入矩阵即可继续行的相关性或者列的相关性，可以选择...
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- 祝让飞
- 发布于 2017-09-11 10:15
- 阅读 ( 11934 )
