热门的文章 - 第10页

一条命令轻松绘制CNS顶级配图-ggpubr

本文转载自“EasyChart”，己获授权。本平台编辑对内容进行测试、修改和补充。 Hadley Wickham创建的可视化包ggplot2可以流畅地进行优美的可视化，但是如果要通过ggplot2定制一套图形，尤其是...

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刘永鑫
发布于 2017-12-27 12:36
阅读 ( 10772 )

怎么下载R的老版本

今天为了使用一个R包的缘故，试了好多个R版本，终于安装上笑哭那么问题来了，怎么下载老版本的R呢嗯，记住这个链接：https://cran.r-project.org/bin/windows/base/old/ 所有的版本的R都...

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祝让飞
发布于 2017-11-02 15:05
阅读 ( 10752 )

Co-occurrence网络图在R中的实现

作者：陈亮单位：中科院微生物所编者按：上个月菌群月坛，在军科院听取王军组陈亮博士分享网络分析的经验，不仅使我对网络的背景知识有了更全面的认识，更使我手上一个关于菌根的课题有极大...

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刘永鑫
发布于 2017-12-07 20:07
阅读 ( 10692 )

一个在线绘制热图的工具

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SXR
发布于 2017-03-30 21:48
阅读 ( 10619 )

宏基因组实战8. 分箱宏基因组binning, MqaxBin, MetaBin, VizBin

前情提要如果您在学习本教程中存在困难，可能因为缺少背景知识，建议先阅读本系统前期文章宏基因组分析理论教程微生物组入门圣经+宏基因组分析实操课程1背景知识-Shell入门与本地blast实战2...

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刘永鑫
发布于 2017-11-21 09:25
阅读 ( 10533 )

KEGG富集分析还可以这么美化

上一讲，讲解富集方法以及结果的可视化，那么这堂课为实战篇复现以下文章中的结果，并使用cytoscape美化可视化结果。 1、开始画面，一如既往的是操作步骤流程图 2、文章中KEGG结果部分解读...

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调研图
发布于 2018-06-15 20:28
阅读 ( 10415 )

博士博后：这是我见过“最掏心窝子”的人才招聘了

招聘广告大家见的多了，无非是以下这样格式化的要求：然而，近日一则招聘广告却让人 “耳目一新” ，这是来自于电子科技大学（成都）邹权老师的博士后招聘，大家感受下：欢迎您

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调研图
发布于 2018-12-20 12:40
阅读 ( 10355 )

孟德尔随机化之基础概念与研究框架

在本期中，我将说明孟德尔随机化的基础概念与研究框架，并解释如何使用孟德尔随机化去解决常规流行病学问题。 2.1 什么是孟德尔随机化？孟德尔随机化是在非实验数据中使用遗传变异

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米老鼠
发布于 2020-09-13 23:20
阅读 ( 10317 )

身边没有电脑，如何让下载文献变得更简单

PC端下载文献的神器有很多，不论是用小软件还是sci-hub都可以做到。但如果恰好身边没有电脑，或者只有一台公共电脑不适合存放私人的文件，这时候咋办呢？方法其实很简单第一步，微

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chris
发布于 2019-03-21 12:51
阅读 ( 10307 )

一行命令从cds的fasta序列转换成bed

数据来源： http://www.plantkingdomgdb.com/tea_tree/data/cds/Teatree_CDS.fas 转换成bed命令： grep '>' Teatree_CDS.fas |awk -F '>' '{print $2}'|awk -F ' ' '{print $3"\t"$1}'...

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祝让飞
发布于 2018-01-21 16:17
阅读 ( 10269 )

文献解读（1）癌症干性，肿瘤内异质性和跨癌症的免疫反应

这篇文章整合多个数据集对癌症的干性、免疫应答和瘤内异质性进行了综合分析，发现了抗肿瘤免疫与肿瘤干性之间的普遍负相关，以及肿瘤干性与肿瘤内异质性之间显著的正相关。无论是研究所用到的数据还是研究所采用的方法以及思路都值得我们学习借鉴。

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柚子
发布于 2020-04-07 16:41
阅读 ( 10231 )

这篇五分多的signature建模文章有点机智啊

最近偶然看到一篇生信建模的文章，思路清奇，让人茅塞顿开。从标题上来看是一篇分析胰腺癌甲基化异常的基因的预后signature，这个题材的文章看个标题就差不多能猜出来干了什么事，但好奇...

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祝让飞
发布于 2019-03-11 14:34
阅读 ( 10098 )

转发：常见的PCA、tSNE、UMAP降维及聚类基本原理及代码实例

这篇文章详细介绍了 PCA、tSNE、UMAP，原始链接为：https://blog.csdn.net/qq_43337249/article/details/116612811 ，以下为备份常见的降维方法基本原理及代码实例 0.前言：什么时候要降维聚...

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祝让飞
发布于 2021-08-24 15:16
阅读 ( 10081 )

叶绿体组装策略

小编在此主要介绍一下一篇文献中叶绿体组装策略，毕竟现在好多植物完成测序，从里面捞点叶绿体数据自己组装发篇小文章还是可以的，嘻嘻。背景第二代测序虽然也能完成对整个基因组序...

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SXR
发布于 2017-03-30 21:54
阅读 ( 10049 )

基因集变异分析（GSVA）分析工具介绍

基因富集分析（Gene set enrichment analysis，GSEA）需要预先有一个有生物学意义的基因集（如同一个通路中的基因），再将基因集内（具有相同意义/功能）的基因一并计算并归纳为单个富集分数。...

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admin
发布于 2021-09-30 11:49
阅读 ( 9974 )

甲基化芯片注释中的CpG shores, open sea 是什么

在甲基化芯片中，对于CpG位点所在的区域，会有对应的注释信息，比如CpG islands。CpG island是基因组上一段CpG位点密度较高的区域，这个概念是非常常见的，出了CpG island 之外，还会有CpG shores, CpG

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菜鸟新手
发布于 2018-08-22 09:10
阅读 ( 9902 )

PASA：提升基因预测的利器

PASA牛叉的利用转录组预测基因

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SXR
发布于 2017-04-01 15:21
阅读 ( 9898 )

宏基因组实战3. MEGAHIT组装拼接及quast评估