热门的文章 - 第6页

R语言基础绘图——韦恩图

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爽儿
发布于 2017-08-09 09:23
阅读 ( 15440 )

批量计算生存分析工具使用例子

以下我们使用GEO的一套数据来演示以下该工具使用首先我们选择下载GSE25065数据集，下载之后使用GEO芯片数据转换器将数据提取出来，最终我们得到了这两个文件打开SampleInfo.xls文件找到随访...

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祝让飞
发布于 2017-08-16 15:39
阅读 ( 15281 )

慕谷·多泰数据挖掘训练营第二期开讲啦！

不是所有培训都能值回票价的，更不是所有培训都赠送价值几千元的线上视频课程！！

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生信分析流
发布于 2018-08-06 10:51
阅读 ( 15243 )

R语言基础绘图——散点图

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爽儿
发布于 2017-07-17 16:22
阅读 ( 15236 )

一键式WGCNA使用教程参数详解

一键式WGCNA总共需要输入两个文件，九个参数，界面如下： 1、表达谱文件：一个表头为样本，第一列为基因名称的表格矩阵 2、样本文件：一个第一列为样本，后面各列为定义的为样本表型的矩阵...

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祝让飞
发布于 2018-10-17 08:44
阅读 ( 15194 )

TCGA套路文章大全

TCGA数据库的肿瘤相关测序数据非常丰富，各种玩法都可以发文章，基本上都是有人带头其余模仿即可

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生信菜鸟团
发布于 2017-07-17 18:14
阅读 ( 15173 )

muscle软件介绍

1、软件介绍 MUSCLE(Multiple Protein Sequence Alignment)是一款蛋白质水平多序列比对的软件，在速度和精度上都优于 ClustalW。在进行多序列比对的时候，大多数情况下可以优先使用 MUSCLE。有...

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SXR
发布于 2017-04-01 09:15
阅读 ( 14958 )

ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色)

作者：严涛浙江大学作物遗传育种在读研究生（生物信息学方向）伪码农，R语言爱好者，爱开源编者按：数据可视化是解析、理解和展示数据不可缺少的一部分。炫或不炫看个人喜好和功

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shengxinbaodian
发布于 2018-08-23 19:06
阅读 ( 14902 )

批量计算相关系数工具使用教程

相关表和相关图可反映两个变量之间的相互关系及其相关方向，但无法确切地表明两个变量之间相关的程度。相关系数是用以反映变量之间相关关系密切程度的统计指标。相关系数是按积差方法计算，同样以两变量与各自平均值的离差为基础，通过两个离差相乘来反映两变量之间相关程度；着重研究线性的单相关系数。

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祝让飞
发布于 2018-04-04 21:56
阅读 ( 14902 )

【DNA甲基化分析系列】450K甲基化谱分析，6篇讲义从零入门

本文由【计算表观遗传学】公众号首发，针对表观遗传领域中研究最为广泛的DNA甲基化修饰及其广泛应用的群体研究中甲基化水平检查芯片技术进行系列讲解，帮助初学者了解芯片甲基化数据的获取、处理及深入分析的流程。感兴趣者可在公众号和社区中留言交流。

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Jason Y.J. Wei
发布于 2017-10-14 09:21
阅读 ( 14730 )

关于Gene ID的转换问题简述

事实上很多时候都需要做基因ID的转换，与其依托于别人的工具不如自己动手，由于研究发表的滞后性，往往很多工具提供的转换并不是最新的，理解转换原理才能让你来去自如

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祝让飞
发布于 2017-06-14 19:48
阅读 ( 14725 )

测序简史

一文从一代到最新的测序技术，希望能够帮助你。

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张海伦
发布于 2017-07-25 17:46
阅读 ( 14707 )

简易数据标准化工具使用说明

简易数据标准化工具

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调研图
发布于 2018-07-12 17:08
阅读 ( 14557 )

火山图绘制工具使用说明

本工具专门用来绘制火山图，可以自由定制颜色，横轴纵轴的最大最小值，导出发表级的图片。软件输入只需两列，一列为foldchang（有没有做log2转换即可），一列为p值（有没有log皆可）软件界...

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祝让飞
发布于 2017-09-29 10:28
阅读 ( 14378 )

R画月亮阴晴圆缺：corrplot绘图相关系数矩阵

今天是十五元宵节，即是和家人团聚的机会，也是赏月的好日子。但作为科研汪的我，在狗年应更加努力，争取在狗年旺旺，从加班狗中脱颖而出。分享一个相关分析可视化实战，祝大家元宵节快乐...

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刘永鑫
发布于 2018-03-01 22:11
阅读 ( 14307 )

GFF3格式说明

GFF3格式说明备忘

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deepxin
发布于 2017-06-19 13:11
阅读 ( 14276 )

R语言做主成分分析实例

主成分分析法是数据挖掘中常用的一种降维算法,是Pearson在1901年提出的,再后来由hotelling在1933年加以发展提出的一种多变量的统计方法，其最主要的用途在于“降维”，通过析取主成分显出的最大的个别差异,也可以用来削减回归分析和聚类分析中变量的数目，与因子分析类似。

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祝让飞
发布于 2017-06-01 12:37
阅读 ( 14201 )

高质量的热图，是什么样的？

这么优秀的热图，只需要10秒，你信吗？

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生信分析流
发布于 2018-08-17 14:16
阅读 ( 14157 )

事实上很多院校对SR、OT都嗤之以鼻，但是今年oncotarget竟然逆势上涨，小编又不小心关注了一下，刚好看到一篇比较简单适合新手入手的文章，今天就来聊一聊这篇不做实验依然发五分以上文章的套路。这篇文章是去年十月份发表在oncotarget上的题目是：A seven-gene signature predicts overall survival of patients with colorectal cancer