R语言基础绘图——柱状图

R语言基础绘图——柱状图

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  • 爽儿
  • 发布于 2017-07-22 18:44
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超详细!三种方法来绘制Venn图

“Venn图是我们科学研究中常用的图形之一,今天小编给小伙伴们介绍三种Venn图绘制工具,小伙伴根据自己的要求进行选择,如果小伙伴觉得对你有帮助,欢迎转发与收藏。”

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  • 柚子
  • 发布于 2020-06-15 15:10
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批量计算相关系数工具使用教程

相关表和相关图可反映两个变量之间的相互关系及其相关方向,但无法确切地表明两个变量之间相关的程度。 相关系数是用以反映变量之间相关关系密切程度的统计指标。相关系数是按积差方法计算,同样以两变量与各自平均值的离差为基础,通过两个离差相乘来反映两变量之间相关程度;着重研究线性的单相关系数。

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  • 祝让飞
  • 发布于 2018-04-04 21:56
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ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色)

作者:严涛 浙江大学作物遗传育种在读研究生(生物信息学方向)伪码农,R语言爱好者,爱开源 编者按:数据可视化是解析、理解和展示数据不可缺少的一部分。炫或不炫看个人喜好和功

简易数据标准化工具使用说明

简易数据标准化工具

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  • 调研图
  • 发布于 2018-07-12 17:08
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用GEO数据不做实验不用编程轻松发两三分的文章

    GEO是目前常用的数据库中收纳数据量最为全面的数据库之一,我们本次基于GEO数据开展一篇生信类型的文章,进行解读、复现、拓展三个方面的解析。     我们本次的总是就是PC端做生信,实现零...

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  • 调研图
  • 发布于 2018-06-15 21:04
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R语言基础绘图——线性回归

R语言基础绘图——线性回归

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  • 爽儿
  • 发布于 2017-08-06 15:43
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R语言做主成分分析实例

主成分分析法是数据挖掘中常用的一种降维算法,是Pearson在1901年提出的,再后来由hotelling在1933年加以发展提出的一种多变量的统计方法,其最主要的用途在于“降维”,通过析取主成分显出的最大的个别差异,也可以用来削减回归分析和聚类分析中变量的数目,与因子分析类似。

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  • 祝让飞
  • 发布于 2017-06-01 12:37
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高质量的热图,是什么样的?

这么优秀的热图,只需要10秒,你信吗?

GEO芯片数据转换器使用说明

随着微阵列芯片技术尤其是基因芯片的广泛应用,产生了海量的数据,为基因研究提供了大量的高通量数据资料,而GEO数据库就是当今最大、最全面的公共基因表达数据资源。用户不仅可以上传自己的数...

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  • 祝让飞
  • 发布于 2017-08-10 10:36
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TCGA简易下载工具V10更新

TCGA简易下载工具V10更新主要在于成熟体miRNA的数据合并上,支持miRNA的isoform合并,从中可以得到新的矩阵然后再使用便捷ID转换器就可以将miRNA的表达谱矩阵转换成-3p、5p的miRNA了

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  • 祝让飞
  • 发布于 2018-01-28 17:24
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RefSeq注释下载及加工

如何从UCSC下载refseq参考基因注释文件

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  • Jinwen
  • 发布于 2017-11-21 15:47
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来自6分新贵杂志的生信数据分析

《柳叶刀》旗下杂志,居然也收生信分析文章..

生信扯上免疫相关就是容易上五分啊

肿瘤微环境细胞和肿瘤中浸润免疫和基质细胞的程度对预后有显着贡献,在肿瘤微环境中,免疫和基质细胞是两种主要类型的非肿瘤组分,并且已被提出对于肿瘤的诊断和预后评估是有价值的;基于ESTIMA...

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  • 祝让飞
  • 发布于 2019-03-11 20:53
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测序简史

一文从一代到最新的测序技术,希望能够帮助你。

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  • 张海伦
  • 发布于 2017-07-25 17:46
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在GEO数据库如何找带有预后信息的数据?一分钟搞定,适用于找任何的样本特征数据

GEO数据库是目前基因表达谱数据数据库之一、里面包含了各种物种的各种测序和芯片平台的数据。详情介绍可以参考这篇文章:https://shengxin.ren/article/454,在这里我们主要介绍怎么快速的获取 ...

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  • 祝让飞
  • 发布于 2020-02-07 10:32
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文章解读:乳腺癌甲基化分型的TCGA公共数据挖掘文章思路解析

这是一篇发表在五分多的杂志上的纯生信的文章,思路清晰,数据获取简便,在其他的癌症的分析中可以套用。

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  • 祝让飞
  • 发布于 2018-05-01 15:04
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【DNA甲基化分析系列】450K甲基化谱分析,6篇讲义从零入门

本文由【计算表观遗传学】公众号首发,针对表观遗传领域中研究最为广泛的DNA甲基化修饰及其广泛应用的群体研究中甲基化水平检查芯片技术进行系列讲解,帮助初学者了解芯片甲基化数据的获取、处理及深入分析的流程。感兴趣者可在公众号和社区中留言交流。

R画月亮阴晴圆缺:corrplot绘图相关系数矩阵

今天是十五元宵节,即是和家人团聚的机会,也是赏月的好日子。 但作为科研汪的我,在狗年应更加努力,争取在狗年旺旺,从加班狗中脱颖而出。 分享一个相关分析可视化实战,祝大家元宵节快乐...

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  • 刘永鑫
  • 发布于 2018-03-01 22:11
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R语言基础绘图——散点图

R语言基础绘图——散点图

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  • 爽儿
  • 发布于 2017-07-17 16:22
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