利用公共数据发文章,基因家族好思路。 虽然我们一直在说可以“用别人的数据,写自己的文章”,但是具体怎么操作,很多同学还是不清楚。今天就用一个完全用公共数据库资源进行分析发文的例子来和大家分享下这方面的思路。
优小白Ulabor,网址 http://www.ulaborbbs.com/ ,欢迎提出宝贵意见!优小白,做一名优秀的科研小白。 by ulaborkz2018
优小白Ulabor生物医学科学论坛开通运营,主要包括基金申报、实验技术交流、生物信息和数据统计、论文撰写投稿交流等版块,有一支30多人的(多人在NSC顶级期刊以第一作者发表论文)的博士团队担...
视频教程讲解基因家族分析方法,真正做到“用别人的数据,发自己的文章”!
如果你对基因组学或者生物信息学感兴趣,那么关注解螺旋的矿工,你一定会有所收获的。
原核生物比较基因组圈图如何展示,BRIG软件教您轻松搞定!
好的分析和可视化,可以提供大量的信息,同时兼顾简洁优雅。 今天我们抛开实验设计、方法和工作量等因素,仅从文章最吸引人的图片来讨论3分和30分(顶级)文章差距在哪里?
线性判别分析LDA 线性判别分析,英文Linear Discriminant Analysis, 以下简称LDA。LDA在模式识别领域(比如人脸识别,舰艇识别等图形图像识别领域)中有非常广泛的应用,在生物学大数据研究中...
基因融合检测软件
RegulomeDB和HaploReg数据库提供了将大量基因组学数据与非编码突变整合的思路。
SesameFG为芝麻功能基因组学研究和分子育种提供了宝贵的资源和工具
背景 有花植物中,雌雄异株的植物仅占6%,涵盖约200个科60个属的14600个物种。所有雌雄异株植物有可能进化出性染色体,其中簸箕柳和芦笋等植物的同型性染色体处于进化早期。通常认为植物性染...
南瓜基因组 万圣节将至,南瓜灯和糖果是其不可缺少的东西,今天小编给大家简单介绍南瓜基因组文章。 背景 南瓜为葫芦科(Cucurbitaceae)南瓜属(Cucurbita)中的一年生草本植物,起源于...
水稻数据库又发表了。
今天跟大家解读下发在gigascience上的三篇基因组文章:大额牛、椰子和人参。
简单介绍基因预测方法 现如今随着测序技术的发展,组装一个完整的基因组也是越来越普遍,价格已经不像前些年那样昂贵(当然超大基因组除外),待基因组组装完成后,基因预测将会是接下来需要进...
今天给大家推荐一款牛叉的三代组装软件,号称资源浪费少,绿色又环保,而且在个人笔记本上毫无压力的软件——MECAT。
TCGA里面主要是通过Affymetrix SNP6.0 array这款芯片来测拷贝数变异!
事实上很多时候都需要做基因ID的转换,与其依托于别人的工具不如自己动手,由于研究发表的滞后性,往往很多工具提供的转换并不是最新的,理解转换原理才能让你来去自如
这几天代表公司参加了Pacbio测序在武汉召开的会议,收获很多,特意跟大家分享下。 小编在学校学习的时候,由于就读于医科院校,老师经常会跟小编和小编的同学们讲,未来每个人都有一个基因身份...