热门的文章 - 第12页

GO的obo文件解析Python代码

在现在的组学研究中几乎离不开GO分析，那么GO是干什么的呢，GO的诞生主要目的是来归类统一生物学方言的（不同的生物学数据库可能会使用不同的术语），它是一个有向无环图（DAG）本体,主要形式是一term标记，每个GO term代表一种功能描述，都属于ontology，而GO总共分成三个ontology:molecular function, cellular component和biological process

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祝让飞
发布于 2017-05-30 18:00
阅读 ( 9319 )

下载TCGA数据的工具

TCGA数据如何下载，吼吼。

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SXR
发布于 2017-03-28 20:31
阅读 ( 9266 )

如何提升系统进化树的颜值？

“高颜值系统进化树”诞生记

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美吉生物
发布于 2018-01-17 17:28
阅读 ( 9260 )

2020年5+生信文章什么样？

话不多说，直奔主题。（看发表时间，很新鲜）这杂志大家也不陌生，都是老朋友了，生信友好型杂志。看看文章都干了什么： 1.故事背景作者系统性的开发了一个跨越不同转录组平台和病人队...

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生信分析流
发布于 2020-03-30 11:33
阅读 ( 9254 )

Nature Genetics：微生物基因组如何适应植物？(news & views)

Nature Genetics于2017年12月18日在线发表了美国北卡教堂山的Jeffery L. Dangl团队(http://labs.bio.unc.edu/Dangl/)领衔，美国能源部JGI研究所的Tanja Woyke和Susannah G. Tringe共同通讯...

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刘永鑫
发布于 2018-01-17 21:26
阅读 ( 9221 )

三维基因组常用分析工具汇总

Hi-C技术主要将空间结构临近的DNA片段进行交联，并将交联的DNA片段富集，然后进行高通量测序，对测序数据进行分析即可揭示全基因组范围内的染色体片段间的交互作用。利用Hi-C技术可以揭示基因组...

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张海伦
发布于 2017-11-06 20:51
阅读 ( 9212 )

2篇五分数据分析文章教你怎么正确的利用CeRNA假说

在pubmed上利用TCGA的数据及CeRNA假说整合分析所发表的文章已经快五十篇了，他们从不同程度上来诠释CeRNA假说以及应用场景，我们都知道ceRNA全称为competing endogenous RNA，是一种能够竞争结...

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祝让飞
发布于 2018-08-17 14:38
阅读 ( 9206 )

漫谈16S的前世今生

本文转载自“微微悦明”，已获授权。本人对内容有编辑和修改。 16S的基础概念 16S rDNA是细菌的系统分类研究中最有用的和最常用的分子钟，其种类少，含量大（约占细菌RNA含量的80％），分子大小...

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刘永鑫
发布于 2017-12-18 23:07
阅读 ( 9159 )

茶基因组解析

茶是世界上最古老，最受欢迎的含咖啡因的饮料，具有极大的经济，药用和文化价值。栽培茶树山茶的重复序列高达80.9％，基因组大小伟3.02Gb。文章发现，由于几个LTR反转录转座子家族的缓慢，稳定...

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百迈客
发布于 2017-05-05 16:55
阅读 ( 9117 )

蛋白互作网络挖掘，轻松获取关键网络模块

这一讲，主要讲解蛋白互作网络构建以及结果优化，那么同样也是我们本次GEO数据挖掘系列的最后一讲，从开始文件章解读到文章中的每一步的分析操作，我们都通过零编程来实现完成，这里避免大家在...

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调研图
发布于 2018-06-15 20:44
阅读 ( 9111 )

生信文章解析（第七篇）非小细胞肺癌中免疫应答相关的突变特征以及驱动基因

研究非小细胞肺癌免疫应答相关的signature的文章，整合了113例经过ICB治疗的非小细胞肺癌样本的体细胞突变谱以及临床信息。研究的目的是刻画经ICB治疗的非小细胞肺癌患者的突变特征和预后。

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柚子
发布于 2019-08-15 10:44
阅读 ( 9097 )

编程模板-R语言脚本写作：最简单的统计与绘图，包安装、命令行参数解析、文件读取、表格和矢量图输出

写在前面个人认为：是否能熟悉使用Shell(项目流程搭建)+R(数据统计与可视化)+Perl/Python等(胶水语言，数据格式转换，软件间衔接)三门语言是一位合格生物信息工程师的标准。之前分享过我个...

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刘永鑫
发布于 2018-01-18 22:55
阅读 ( 9095 )

miRNA 综述文章阅读笔记

miRNA研究综述

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SXR
发布于 2017-03-28 20:54
阅读 ( 9063 )

分享一个基因融合(Gene_Fusion)检测的新软件--Arriba

基因融合检测软件

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文虎
发布于 2017-12-24 15:58
阅读 ( 9028 )

推荐一个软件：GFFview

A Web Server for Parsing and Visualizing Annotation Information of Eukaryotic Genome 大家好，今天给大家推荐一款软件，GFFview ，顾名思义这款软件主要用于gff文件的可视化展示。相信...

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张海伦
发布于 2017-06-03 10:31
阅读 ( 8995 )

宏基因组分析教程-Analysis of Metagenomic Data

加拿大安大略研究所建立的生物信息网(https://bioinformatics.ca/)，每年组织多场生物信息学线下培训，并线上共享培训资料。有超多生信学习PPT和视频，每一份都价值不菲。2016年6月22-24日，在温哥华举办了宏基因组数据分析专题培训，我们可以点击主页中宏基因组专题栏目的 "Access Content" 访问这次培训的材料。