更新了!《TCGA数据下载的终极篇》

《TCGA数据下载的终极篇》

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  • 柚子
  • 发布于 2020-04-28 10:41
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GO的obo文件解析Python代码

在现在的组学研究中几乎离不开GO分析,那么GO是干什么的呢,GO的诞生主要目的是来归类 统一生物学方言的(不同的生物学数据库可能会使用不同的术语),它是一个有向无环图(DAG)本体,主要形式是一term标记,每个GO term代表一种功能描述,都属于ontology,而GO总共分成三个ontology:molecular function, cellular component和biological process

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  • 祝让飞
  • 发布于 2017-05-30 18:00
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如何提升系统进化树的颜值?

“高颜值系统进化树”诞生记

MECAT:PC组装人的基因组

今天给大家推荐一款牛叉的三代组装软件,号称资源浪费少,绿色又环保,而且在个人笔记本上毫无压力的软件——MECAT。

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  • 张海伦
  • 发布于 2017-06-26 16:31
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编程模板-R语言脚本写作:最简单的统计与绘图,包安装、命令行参数解析、文件读取、表格和矢量图输出

写在前面 个人认为:是否能熟悉使用Shell(项目流程搭建)+R(数据统计与可视化)+Perl/Python等(胶水语言,数据格式转换,软件间衔接)三门语言是一位合格生物信息工程师的标准。 之前分享过我个...

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  • 刘永鑫
  • 发布于 2018-01-18 22:55
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干货|互作转录组

Dual RNA seq

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  • 张海伦
  • 发布于 2017-08-03 21:00
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多因素回归分析工具 使用教程

先上图,后补充

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  • 祝让飞
  • 发布于 2018-08-22 15:33
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漫谈16S的前世今生

本文转载自“微微悦明”,已获授权。本人对内容有编辑和修改。 16S的基础概念 16S rDNA是细菌的系统分类研究中最有用的和最常用的分子钟,其种类少,含量大(约占细菌RNA含量的80%),分子大小...

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  • 刘永鑫
  • 发布于 2017-12-18 23:07
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桌面版SCI-Hub,简单易用,再也不用担心找不到可用的SCI-hub网址了

最近SCI-Hub风雨飘摇,今天收藏的网址明天就不能用了,心碎的很,某程序员同学一机灵就弄了个桌面版的SCI-Hub,丢到了工具盒中

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  • 调研图
  • 发布于 2017-12-22 11:08
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Nature Genetics:微生物基因组如何适应植物?(news & views)

Nature Genetics于2017年12月18日在线发表了美国北卡教堂山的Jeffery L. Dangl团队(http://labs.bio.unc.edu/Dangl/)领衔,美国能源部JGI研究所的Tanja Woyke和Susannah G. Tringe共同通讯...

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  • 刘永鑫
  • 发布于 2018-01-17 21:26
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单基因泛癌分析工具

从早先的2.0版本更新而来,拆分成不同的部分,每个部分均可以定制分析

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  • admin
  • 发布于 2021-11-10 18:11
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读了这篇文章,你也能无代码生信分析发四分SCI

其实前段时间小编已经给大家分享了单基因泛癌分析,拿着自己研究的基因,通过Sangger box云平台就可以得到了属于自己的单基因分析报告(如果有兴趣的话可以去翻一下那篇文章) 强调:代码编程和网页小工具只是数据分析方法,重要是研究思路,如何将分析结果将生物学含义联系起来才是至关重要的点。 下面这篇文章的分析内容比小伙伴们拿到的那份分析报告内容少了很多,但是文章分数却不低,文章的题目虽然是关于胃癌的,但是作者研究的研究思路却是泛癌,值得小伙伴们借鉴。一起来看看吧!

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  • 欢乐豆
  • 发布于 2020-06-16 09:39
  • 阅读 ( 9444 )

你得明白为什么一个基因对应多个探针

一个基因对应多个探针

对方向扔了一个赤果果的生信分析SCI思路

很久没有写稿子了,今天给大家分享一篇纯生信的SCI,思路简单粗暴。文章2017年发表在Oncotarget上(虽然已经牺牲了),但是我们可以取其精华呀,只要还有值得我们学习的地方,我们就挖掘出来。

宏基因组分析教程-Analysis of Metagenomic Data

加拿大安大略研究所建立的生物信息网(https://bioinformatics.ca/),每年组织多场生物信息学线下培训,并线上共享培训资料。有超多生信学习PPT和视频,每一份都价值不菲。2016年6月22-24日,在温哥华举办了宏基因组数据分析专题培训,我们可以点击主页中宏基因组专题栏目的 "Access Content" 访问这次培训的材料。

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  • 刘永鑫
  • 发布于 2017-10-12 21:59
  • 阅读 ( 9291 )

分享一个基因融合(Gene_Fusion)检测的新软件--Arriba

基因融合检测软件

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  • 文虎
  • 发布于 2017-12-24 15:58
  • 阅读 ( 9290 )

推荐一个软件:GFFview

A Web Server for Parsing and Visualizing Annotation Information of Eukaryotic Genome 大家好,今天给大家推荐一款软件,GFFview ,顾名思义这款软件主要用于gff文件的可视化展示。 相信...

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  • 张海伦
  • 发布于 2017-06-03 10:31
  • 阅读 ( 9254 )

权威解析!2018年国自然基金中的“热点”表现如何?

2018年国自然基金评审结束,今年基金委共资助面上项目18,947项、青年科学基金项目17,671项、优秀青年科学基金项目400项、重点项目701项、重大项目1项、重点国际(地区)合作研究项目106项。 其

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  • 祝让飞
  • 发布于 2018-08-19 10:26
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医学统计学-卡方检验

1. 卡方分布当自由度趋于无穷大时,图形趋于正态分布 # 产生服从卡方分布的观测数为1000的样本 df_n <- seq (1 , 5 ) chisq_data <- function (n ){  x <- seq (- 0.2 , 16 , length = 300 )  prob &lt

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  • 生信
  • 发布于 2018-08-30 08:58
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基因预测,你有考虑串联重复基因吗?

串联基因在基因预测中还是很难处理的,你有考虑吗?

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  • SXR
  • 发布于 2017-03-28 20:25
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