热门的文章 - 第16页

R堆叠柱状图各成分连线画法：突出展示组间物种丰度变化

作者：朱微金李陈浩堆叠柱状图连线画法提出问题 18年1月29日宏基因组转载了中科院生态中心邓晔组的文章《土壤细菌定量方法结合相对丰度分析揭示种群的真实变化》。其中的图3基于堆叠柱状图...

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刘永鑫
发布于 2018-02-01 18:37
阅读 ( 7452 )

R语言交互式可视化包CanvasXpress

作者简介刘永鑫，博士。2008年和2011年毕业东北农业大学微生物学和作物遗传育种专业。2014年在中科院遗传发育所获生物信息学博士学位，2016年博士后出站留所工作，任宏基因组学实验室工程师，...

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刘永鑫
发布于 2018-02-15 11:18
阅读 ( 7419 )

你还不会安装Circos？其实就三步！！！

本文内容首发于【计算表观遗传学】公众号，对表观遗传学领域感兴趣的朋友可以移步了解更多。如有疑问可留言交流。

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Jason Y.J. Wei
发布于 2017-10-13 16:55
阅读 ( 7408 )

芦笋基因组揭示了Y染色体的起源和进化

背景有花植物中，雌雄异株的植物仅占6%，涵盖约200个科60个属的14600个物种。所有雌雄异株植物有可能进化出性染色体，其中簸箕柳和芦笋等植物的同型性染色体处于进化早期。通常认为植物性染...

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张海伦
发布于 2017-11-06 20:49
阅读 ( 7369 )

加权基因共表达网络（WGCNA）寻找与疾病相关的hub基因

低成本发一篇sci，你也可以的！！！快来围观吧！

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组学生物
发布于 2018-07-13 09:58
阅读 ( 7360 )

支持两千多个芯片平台的简易ID转换工具

基因ID转换是做数据分析过程中最常见的工作，在这里我们整理了两千多个基因芯片平台的注释基因，利用genecard 进行了统一的匹配，提供了一个简易的ID转换工具。简易的输入界面：点击开始分...

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admin
发布于 2021-11-08 21:21
阅读 ( 7345 )

R语言可以这么玩 |可视化中文分词和词频统计！~

中文分词，R语言也可以搞定！~

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易统计
发布于 2017-04-24 15:33
阅读 ( 7322 )

基因组学数据分析常用的在线资源

最前沿的在线资源列表

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Bryce
发布于 2017-11-22 23:19
阅读 ( 7276 )

微生物多样性分析神器Qiime的centos 6.7的安装历程

QIIME （Quantitative Insights Into Microbial Ecology）是一个专门针对于微生物群落的分析pipline，可以进行OTU,以及多样性分析等等。拥有处理16s rRNA所需要的软件并呈现相应的处理结果。所谓分析pipline必是集成软件，QIIME也不例外。因此安装起来超级麻烦。

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祝让飞
发布于 2017-05-26 21:39
阅读 ( 7269 )

参考简易TCGA下载小工具简单介绍TCGA

TCGA产生背景目前人们研究最多的疾病非癌症莫属。从人类基因组计划完成后，癌症研究也早已步入基因组学时代，正因如此，人们急需一个能整合多种癌症基因组测序数据的功能强大的数据库平...

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金晓妍
发布于 2017-05-07 22:28
阅读 ( 7268 )

两篇胃癌lncRNA signature文章解读之一（IF=7.7）

这是一篇2016年的文章，文章从lncRNA的角度筛选lncRNA signature，该文章发表在Molecular Cancer上，影响因子如下：下面我们一起来解析一下这篇文章文章标题如：看signature大体思路...

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祝让飞
发布于 2018-10-08 21:01
阅读 ( 7241 )

分享一段从KEGG通路中提取基因互作数据的R代码

从KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）网站上获得差异表达基因所富集通路的XML文件。使用R包XML提取这些XML文件中的relation，entry和group关系。然后利用脚本组合它们从中提取其...

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祝让飞
发布于 2019-03-21 15:10
阅读 ( 7220 )

GST pull down原理：先将体外表达的GST融合蛋白结合到谷胱甘肽Beads上，再将靶蛋白-GST-Beads和细胞裂解液孵育，这样互作蛋白便一起吸附在Beads上。洗涤掉未结合的蛋白后，再用洗脱液将互作蛋白复合物从Beads洗脱下来，即GST pulldown产物。这种互作复合物既可以用WesternBlot检测已知蛋白，也可以用质谱鉴定出未知蛋白。广泛应用于筛选或验证和靶蛋白的互作蛋白。