你还不会安装Circos？其实就三步！！！
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- Jason Y.J. Wei
- 发布于 2017-10-13 16:55
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Jason Y.J. Wei
干货收藏！生命科学和医学SCI期刊大汇总！
图片 | 摄图网 SCI的全称为Science Citation Index，翻译过来是“科学引文索引”。 SCI论文是被SCI索引收录的期刊所刊登的论文。SCI的原意是要帮助科研人员有效获取文献信息。 SCI现在对科研
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- 生信分析流
- 发布于 2018-08-26 13:07
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生信分析流
芦笋基因组揭示了Y染色体的起源和进化
背景 有花植物中，雌雄异株的植物仅占6%，涵盖约200个科60个属的14600个物种。所有雌雄异株植物有可能进化出性染色体，其中簸箕柳和芦笋等植物的同型性染色体处于进化早期。通常认为植物性染...
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- 张海伦
- 发布于 2017-11-06 20:49
- 阅读 ( 7155 )
张海伦
组学生物
微生物多样性分析神器Qiime的centos 6.7的安装历程
QIIME （Quantitative Insights Into Microbial Ecology）是一个专门针对于微生物群落的分析pipline，可以进行OTU,以及多样性分析等等。拥有处理16s rRNA所需要的软件并呈现相应的处理结果。所谓分析pipline必是集成软件，QIIME也不例外。因此安装起来超级麻烦。
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- 祝让飞
- 发布于 2017-05-26 21:39
- 阅读 ( 7131 )
祝让飞
易统计
参考简易TCGA下载小工具简单介绍TCGA
TCGA产生背景 目前人们研究最多的疾病非癌症莫属。从人类基因组计划完成后，癌症研究也早已步入基因组学时代，正因如此，人们急需一个能整合多种癌症基因组测序数据的功能强大的数据库平...
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- 金晓妍
- 发布于 2017-05-07 22:28
- 阅读 ( 7107 )
金晓妍
两篇胃癌lncRNA signature文章解读之一（IF=7.7）
这是一篇2016年的文章，文章从lncRNA的角度筛选lncRNA signature，该文章发表在Molecular Cancer上，影响因子如下： 下面我们一起来解析一下这篇文章 文章标题如： 看signature大体思路...
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- 祝让飞
- 发布于 2018-10-08 21:01
- 阅读 ( 7084 )
单组或多组相关性散点图
计算两组数据的相关性，用散点图和拟合曲线可以完美展示数据内在的分布，在这里我们开发了相关性散点图的简易绘制工具，不仅可以支持单组数据，也支持多组数据绘制在一张图上或者绘制在多张图上...
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- admin
- 发布于 2021-07-29 09:59
- 阅读 ( 7081 )
admin
分享一段从KEGG通路中提取基因互作数据的R代码
从KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）网站上获得差异表达基因所富集通路的XML文件。使用R包XML提取这些XML文件中的relation，entry和group关系。然后利用脚本组合它们从中提取其...
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- 祝让飞
- 发布于 2019-03-21 15:10
- 阅读 ( 7016 )
支持两千多个芯片平台的简易ID转换工具
基因ID转换是做数据分析过程中最常见的工作，在这里我们整理了两千多个基因芯片平台的注释基因，利用genecard 进行了统一的匹配，提供了一个简易的ID转换工具。简易的输入界面： 点击 开始分...
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- admin
- 发布于 2021-11-08 21:21
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Bryce
SXR
如何提问才能获得更多回答
爱因斯坦曾说：“提出一个问题往往比解决一个问题更为重要，因为解决一个问题也许只是一个数学上或实验上的技巧问题。而提出新的问题、新的可能性，从新的角度看旧问题，却需要创造性的想像力，而且标志着科学的真正进步。”
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- admin
- 发布于 2017-03-28 20:55
- 阅读 ( 6925 )
用公共数据发文章-基因家族分析好思路
利用公共数据发文章，基因家族好思路。 虽然我们一直在说可以“用别人的数据，写自己的文章”，但是具体怎么操作，很多同学还是不清楚。今天就用一个完全用公共数据库资源进行分析发文的例子来和大家分享下这方面的思路。
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- 组学生物
- 发布于 2018-07-13 10:01
- 阅读 ( 6922 )
做富集分析不一定非得用R,结果依然秀色可餐
那么经过前面一系列的操作后，终于拿到我们需要的差异基因，下面就要开始这些差异基因的表演了，估计大家首先想到就是这些基因有一个什么功能，首选就是KEGG和GO富集分析，目前大家常用的是...
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- 调研图
- 发布于 2018-06-15 20:11
- 阅读 ( 6907 )
调研图
GST pull down实验—gst融合蛋白沉降技术原理
GST pull down原理：先将体外表达的GST融合蛋白结合到谷胱甘肽Beads上，再将靶蛋白-GST-Beads和细胞裂解液孵育，这样互作蛋白便一起吸附在Beads上。洗涤掉未结合的蛋白后，再用洗脱液将互作蛋白复合物从Beads洗脱下来，即GST pulldown产物。这种互作复合物既可以用WesternBlot检测已知蛋白，也可以用质谱鉴定出未知蛋白。广泛应用于筛选或验证和靶蛋白的互作蛋白。
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- 辉骏生物
- 发布于 2021-04-15 17:00
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辉骏生物
