热门的文章 - 第14页

cBioportal (含TCGA)数据的分组与下载

TCGA基因表达的数据分组、数据下载

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weilong
发布于 2023-02-01 13:21
阅读 ( 9383 )

干货|基因注释方法论

简单介绍基因预测方法现如今随着测序技术的发展，组装一个完整的基因组也是越来越普遍，价格已经不像前些年那样昂贵（当然超大基因组除外），待基因组组装完成后，基因预测将会是接下来需要进...

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张海伦
发布于 2017-08-02 20:36
阅读 ( 9378 )

基因预测，你有考虑串联重复基因吗？

串联基因在基因预测中还是很难处理的，你有考虑吗？

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SXR
发布于 2017-03-28 20:25
阅读 ( 9376 )

权威解析！2018年国自然基金中的“热点”表现如何？

2018年国自然基金评审结束，今年基金委共资助面上项目18,947项、青年科学基金项目17,671项、优秀青年科学基金项目400项、重点项目701项、重大项目1项、重点国际（地区）合作研究项目106项。其

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祝让飞
发布于 2018-08-19 10:26
阅读 ( 9374 )

宏基因组实战2. 数据质控fastqc, Trimmomatic, MultiQC, khmer

本文英文原版见下方github链接，由中科院朱微金博士翻译、测试、并进行中文注释和补充，全网首发“宏基因组”公众号。 https://2017-cicese-metagenomics.readthedocs.io/en/latest/toc.html 前...

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刘永鑫
发布于 2017-10-26 13:51
阅读 ( 9363 )

生信文章解析（第二篇）使用深度学习的方法整合多组学数据预测肝癌预后

作者使用深度学习的方法整合多组学数据，对HCC样本群进行了预后分型，并且评估了模型的鲁棒性，及分型效能，对这个方法感兴趣或者也在研究预后的小伙伴可以仔细研读下这篇文献哦。

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柚子
发布于 2019-07-30 10:55
阅读 ( 9307 )

StringTie:一个转录组软件

新的转录组标表达定量软件

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SXR
发布于 2017-04-01 15:27
阅读 ( 9241 )

文章分享（一）What？肿瘤纯度是一个潜在的关键因素

在胶质瘤组织中不仅仅只包含胶质瘤细胞，也存在与胶质瘤相关的非肿瘤细胞，如基质细胞以及免疫细胞。这些非肿瘤细胞稀释了胶质瘤细胞的纯度，并且在胶质瘤的生物学过程中起到重要作用，但是胶质瘤纯度变化的影响仍不是十分清楚，这篇文章旨在研究这个问题。

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柚子
发布于 2019-07-25 10:07
阅读 ( 9240 )

宏基因组实战5. sourmash基于Kmer比较数据集

前情提要如果您在学习本教程中存在困难，可能因为缺少背景知识，建议先阅读本系统前期文章宏基因组分析理论教程微生物组入门圣经+宏基因组分析实操课程1背景知识-Shell入门与本地blast实战2...

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刘永鑫
发布于 2017-11-07 08:56
阅读 ( 9239 )

WGCNA分析，简单全面的最新教程

本文应该是第二全的WGCNA分析教程，参考了最新的文档。第一全的还在路上，会出现于生信宝典和宏基因组公众号组织的二代三代转录组测序分析实战班上，欢迎点击链接了解更多。 WGCNA基

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shengxinbaodian
发布于 2018-10-26 18:01
阅读 ( 9193 )

单组或多组相关性散点图

计算两组数据的相关性，用散点图和拟合曲线可以完美展示数据内在的分布，在这里我们开发了相关性散点图的简易绘制工具，不仅可以支持单组数据，也支持多组数据绘制在一张图上或者绘制在多张图上...

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admin
发布于 2021-07-29 09:59
阅读 ( 9163 )

TCGA ID转换器使用说明

为了便于新版TCGA RNA-Seq数据的转换提取，特制作RNA-Seq数据的ENSG_ID转换成lncRNA、编码蛋白基因、假基因等的转换器

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祝让飞
发布于 2017-08-04 17:05
阅读 ( 9129 )

宏基因组实战6. 不比对快速估计基因丰度Salmon

前情提要如果您在学习本教程中存在困难，可能因为缺少背景知识，建议先阅读本系统前期文章宏基因组分析理论教程微生物组入门圣经+宏基因组分析实操课程1背景知识-Shell入门与本地blast实...

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刘永鑫
发布于 2017-11-08 21:09
阅读 ( 9085 )

测序各种名词解释，都在这里

收集的各种测序名词解释，Contig，Assembly，等等都在这里了

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SXR
发布于 2017-04-05 09:49
阅读 ( 9081 )

16S+功能预测也能发Sciences：尸体降解过程中的微生物组

Metcalf, J. L., et al. (2016). "Microbial community assembly and metabolic function during mammalian corpse decomposition." Science 351(6269): 158-162. 于2015年12月10日在线发表，...

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刘永鑫
发布于 2018-03-21 20:13
阅读 ( 9062 )

宏基因组分析实战教程1. 背景知识

上次我写的学习经验和推荐的教程——《微生物组入门必读+宏基因组实操课程=新老司机赶快上车》，小伙伴们当天阅读破2700+人次，3.5天破3000+，达到了宏基因组快车满三千人发车的要求。我也按约定...

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刘永鑫
发布于 2017-10-23 20:37
阅读 ( 8977 )

多种生信套路组合——发4分的文章

这篇文章今年1月份发表在J Cell Mol Med上；文章只有两套数据，一套训练集和一套验证集；作者构建的模型AUC也不是很高，但是文章的分数发了4.6分。主要原因是作者能够将很多常规分析串起来，这些分析大家在泛癌课程和之前分享的文章、小工具推文中大家都接触过。所以小编提议大家多看文章，英文看不懂，没有关系，可以先看小编的解读，再看看原文，锻炼自己的思维。