生信分析流
孤傲的小丑皇
DNA pull down实验技术
DNA pull down-MS是体外研究DNA与蛋白互作的有力工具。该技术将生物素标记的DNA片段结合在链霉亲和素磁珠上，再与细胞核蛋白孵育，纯化出与DNA片段互作的蛋白，洗涤洗脱得到的蛋白产物，做western-blot检测特定蛋白是否与靶DNA片段结合；做质谱鉴定即可筛选出与DNA片段可能互作的蛋白信息（如具体某个或某些转录因子/组蛋白等）。
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- 辉骏生物
- 发布于 2018-10-18 14:20
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辉骏生物
一键式WGCNA使用教程参数详解
一键式WGCNA总共需要输入两个文件，九个参数，界面如下： 1、表达谱文件：一个表头为样本，第一列为基因名称的表格矩阵 2、样本文件：一个第一列为样本，后面各列为定义的为样本表型的矩阵...
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- 祝让飞
- 发布于 2018-10-17 08:44
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祝让飞
两篇文章一字之差，影响因子差了三倍，他们都干了啥？（第二篇）
话不多说先上图： 最近在写工具盒里WGCNA工具的使用教程，检索素材时发现了一篇文章，哦不，是两篇，他们长的几乎一样，且看： Prognostic Genes of Breast Cancer Identified by Gene Co-e...
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- 祝让飞
- 发布于 2018-10-16 16:27
- 阅读 ( 7674 )
两篇文章一字之差，影响因子差了三倍，他们都干了啥？（第一篇）
话不多说先上图： 最近在写工具盒里WGCNA工具的使用教程，检索素材时发现了一篇文章，哦不，是两篇，他们长的几乎一样，且看：Prognostic Genes of Breast Cancer Identified by Gene Co-exp...
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- 祝让飞
- 发布于 2018-10-16 16:19
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一篇典型的WGCNA文章解读
我们鉴定了两个模块和10个hub基因，这些基因与OSCC的肿瘤发生有关。 这两个模块提供的参考将促进对OSCC中肿瘤发生机制的理解。 此外，hub基因可以作为生物标志物和治疗靶标，用于未来OSCC的精确诊断和治疗。
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- 生信分析流
- 发布于 2018-10-16 13:25
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【求助】DECenter中edgR报错
样本共分有2组 1组样本共有375个 0组样本共有32个 ========= ========= 运行R命令："C:\Users\kesongs\Desktop\Sanger\source\softs\R-Portable\App\R-Portable\bin\Rscript.exe" "C:\dec_...
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- kesongs
- 发布于 2018-10-16 10:49
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kesongs
服务器里删过SSL的后遗症,R不能正常的安装包了，错误：status was 'Peer certificate cannot be authenticated with given CA certificates
技术不小心删了openssl，然后没挽救回来，通过各种折腾终于能进系统了，各方便都感觉修复了，唯独这个R无法正常的使用install.packages和biocLite来安装依赖包，究其原因则是CA证书错误，status...
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- 祝让飞
- 发布于 2018-10-11 11:18
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第三篇lncRNA signature的文章解析，IF五分胶质瘤
这是一篇比较老的建模的文章，发表在Neurobiology of Disease上，目前影响因子五分多点。 Long non-coding RNA expression profiles predict clinical phenotypes in glioma 本文从lncRNA...
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- 祝让飞
- 发布于 2018-10-09 17:06
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两篇胃癌lncRNA signature文章解读之二（IF=3.2）
这是一篇2017年的文章，文章从lncRNA的角度筛选lncRNA signature，该文章发表在Journal of Cancer上，影响因子如下： 文章题目为：Differentially Expressed lncRNAs in Gastric Cancer Patien...
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- 祝让飞
- 发布于 2018-10-09 09:06
- 阅读 ( 4827 )
pre-mRNA中存在的修饰及其对剪接影响
撰文丨苗苗 责编丨迦溆 日前，作为“诺贝尔奖风向标”的拉斯克奖——拉斯克·科什兰医学特殊成就奖颁给了Joan Argetsinger Steitz教授（致敬Joan Steitz！2018年拉斯克特别成就奖获得者），以表
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- 祝让飞
- 发布于 2018-10-09 07:56
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两篇胃癌lncRNA signature文章解读之一（IF=7.7）
这是一篇2016年的文章，文章从lncRNA的角度筛选lncRNA signature，该文章发表在Molecular Cancer上，影响因子如下： 下面我们一起来解析一下这篇文章 文章标题如： 看signature大体思路...
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- 祝让飞
- 发布于 2018-10-08 21:01
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免疫治疗系列（一）——节后第一天，温习故事吧！
我们生物科研工作者对诺贝尔奖一定不感到陌生。今年10月1号， 2018年度诺贝尔生理学或医学奖（我一直觉得这里用个和是不是语法更通顺，但是不重要）颁布的消息刷爆了小
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- 生信分析流
- 发布于 2018-10-08 11:20
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ConsensusClusterPlus未选择最优阈值的用法案例
我们常用ConsensusCluster来做聚类或者寻找分子亚型，常见的用法是考虑CDF下降坡度稳定小，比如图B、D中应该是k=5，然而有时候选择该值未必完全遵循此规律。 比如这篇CCR的文章，就没有按照...
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- 祝让飞
- 发布于 2018-10-08 09:10
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Cell：首次解析出CRISPR-Cas13d的三维结构
源自最初在细菌中发现的基因，CRISPR被描述为“分子剪刀”。它将一段遗传密码换成另一段遗传密码。在CRISPR-Cas9系统中，Cas9是切割DNA的酶。 图片来自Cell, doi:10.1016/j.cell.2018.09.001。 在过去
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- 生信分析流
- 发布于 2018-09-30 15:37
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关于细胞自噬，这些你都知道吗？
细胞自噬是指在自噬相关基因的调控下，利用溶酶体降解自身受损的细胞器及大分子物质的过程，以此维持细胞自身的需要及细胞器的更新。 一、细胞自噬的基本概念及特征 1、自噬的过程
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- 生信分析流
- 发布于 2018-09-30 13:43
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SCHISM 构建克隆进化树
SCHISM介绍 SCHISM是一种计算工具，旨在推断亚克隆层次结构和肿瘤从体细胞突变的演变。推理过程涉及肿瘤进化的两个基本属性的计算评估：谱系优先规则和谱系分歧规则 基于体细胞突变细胞...
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- 吴婷婷
- 发布于 2018-09-26 17:08
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吴婷婷
文章解读——基于20个基因的预后模型预测肺腺癌的生存
基于20个基因的预后模型预测肺腺癌的生存 Twenty-gene-based prognostic model predicts lung adenocarcinoma survival 肺腺癌（LAC）占非小细胞肺癌的一半以上，它具有高发病率和死亡率...
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- 生信分析流
- 发布于 2018-09-18 15:48
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【资源网站集合2】免费在线编辑工具
【往期回顾】 点击文字跳转： 【功能群】 —专利检索下载网站 SCI Translate 8：科技论文全文翻译利器 在校外也可以访问Web of Science 五款在线 PDF编辑工具（几乎解决所有的PDF问题） PPT模板
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- 调研图
- 发布于 2018-09-17 16:26
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调研图
